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科学家揭示猎隼青藏高原适应的遗传机制

2022-10-28 动物研究所
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  青藏高原被称为“世界第三极”,与北极地区具有相似的极寒气候,栖息于两地的某些哺乳动物展现出相似的低温适应表型(如厚重的毛发、庞大的体型等)。那么,是否存在两极地物种间与低温适应相关的基因流动?除低温外,高原动物还面临低氧、强紫外(UV)辐射等极端环境的生存挑战。既往关于高原动物的适应性进化的研究多围绕低氧适应,而对低温、强UV环境的适应机制所知甚少。

  10月27日,澳门赌场动物研究所詹祥江实验室在国际综合期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上,在线发表了题为Arctic introgression and chromatin regulation facilitated rapid Qinghai-Tibet Plateau colonization by an avian predator的研究论文。该研究结合多组学分析和功能实验,首次发现了北极近缘物种对于青藏高原动物适应性进化的遗传贡献,并系统性地探讨了高原动物如何适应低温、低氧、强UV胁迫的遗传机制。

  猎隼(Falco cherrug),是青藏高原的代表性猛禽,广泛分布于欧亚大陆和北非的内陆草原和丘陵地区,以及我国新疆、内蒙、东北等地区。而它的近缘种矛隼(F. rusticolus)现在主要栖息于北极和亚北极地区的冻土苔原和森林苔原地带。该研究主要基于三代测序技术,组装了染色体水平的猎隼基因组;同时,对源自欧亚大陆的三大主要繁殖地的30只猎隼个体以及欧亚北极地区的10只矛隼个体进行种群基因组学研究。研究发现,东部猎隼种群中超过20%的等位基因位点来源于矛隼渗入(Introgression)。研究人员对两者历史栖息地模拟发现,末次盛冰期(LGM)时期矛隼从北极向南迁移,在西伯利亚南部与猎隼发生杂交,其婚配方式主要以雌性矛隼与雄性猎隼杂交为主。种群遗传学研究揭示,猎隼逐步扩散至青藏高原的可能路线是:约4.1(3.8-7.8)万年前,猎隼从中欧地区扩散到亚洲东部;LGM时期,东部猎隼种群与矛隼杂交;约1.0(0.8-1.2)万年前,猎隼种群从蒙古拓殖至青藏高原地区。这使得科研人员能够探索猎隼在青藏高原快速的适应性进化过程。

  在低温适应方面,研究发现生活在寒冷地区的高原猎隼比西部猎隼体型更大、体重更重,这一现象符合贝格曼法则。科研人员在高原猎隼基因组中发现了两个相关的渗入基因——SCMH1SCARB1SCMH1内含子上的渗入片段具有更强的抑制效应,使基因表达下降,进而可能使其下游与身体发育相关的HOX基因表达上调,引起猎隼体型增大。此外,渗入型的SR-B1P121L(由SCARB1编码)氨基酸突变,利于高原猎隼清除血液中更多的胆固醇,降低寒冷条件下脂质增加的负效应。由此可见,从北极近缘种中渗入的关键基因,有助于猎隼更好地栖息于青藏高原的低温环境。在低氧适应方面,研究利用基因组、三维基因组和转录组分析发现,高原猎隼基因组中一段受选择最强的区域(500 Kb),折叠成一个拓扑结构域(TAD),使得该区段内的调控元件与血红蛋白基因间的互作增强,促进血红蛋白表达量显著升高,响应低氧压力。在强UV适应方面,研究通过比较羽毛的反射光谱发现,高原猎隼呈现更深的羽色。基因组上与色素沉积相关的基因ASIP的一段内含子区受到正选择。高原型片段的增强效应减弱,因而减少了ASIP基因的表达,促进真黑色素的合成,这可能减少了UV对高原猎隼的损伤。

  该研究聚焦于高原动物适应极端环境的遗传机制,运用基因组学、表观基因组学和功能基因组学技术,阐明了猎隼快速拓殖青藏高原的过程,发现了由北极姊妹种矛隼渗入的2个低温适应关键基因,并揭示了非编码区突变在低氧、强UV适应相关基因表达调控中的重要作用,为动物适应高原极端生境提供了新见解。该研究由动物所主导,蒙古野生动物科学与保护中心、斯洛伐克猛禽保护中心、俄罗斯科学院乌拉尔分院等单位合作完成。研究工作得到国家自然科学基金、澳门赌场战略性先导科技专项、第三次新疆综合科学考察、第二次青藏高原综合科学考察研究、三江源国家公园等的支持。

  论文链接 

猎隼逐步拓殖到青藏高原

打印 责任编辑:侯茜

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